由于種種原因，反滲透膜分離技術在實際應用中，不可避免的會產生膜污染現象，且膜污染問題是影響該技術穩定性的決定性因素，污堵也是造成某些系統運行成本居高不下的原因之一。控制反滲透污染一般集中在前期預處理上，但是經驗表明現有反滲透水處理只有預處理往往是不夠的，無論預處理系統如何完善，日常操作如何嚴格，在長期運行中膜表面上會逐漸有各種污染物的沉積而引起膜的污染，而反滲透技術經濟性在很大程度上受膜污染的影響。膜的定期清洗是防治膜污染的主要措施之一，膜清洗可將膜表面的污染物去除，使膜的性能得到最大限度的恢復。

反滲透系統在運行過程中，水中的金屬離子、微生物、不易溶解的微粒、有機污染物、生物黏泥、膠體、油脂等長時間與膜接觸，會引起膜的污染，使膜的通量及分離性能明顯降低、壓降升高。

在反滲透膜發生污染后要采取有效的消毒和清洗手段。江蘇中浩遠達生產的反滲透膜處理藥劑有以下性質

1不損壞膜

2能夠控制和殺滅所有種類的細菌和生物膜

3能夠破壞已形成的生物膜

4有效去除氧化性反應隱患

5無毒且易于操作

6可生物降解，易于處置

7易于監測和加注